Ο φάκελος αδειοδότησης υποβάλλεται στην Αρμόδια Αδειοδοτούσα Αρχή (ΑΑΑ) η οποία στην προκειμένη περίπτωση είναι η Δ/νση Αγροτικής Οικονομίας και Κτηνιατρικής της οικείας Περιφερειακής Ενότητας εντός των ορίων της οποίας είναι εγκατεστημένη η κτηνοτροφική εγκατάσταση.